Sollte der Schaden im Zahn schon etwas größer sein und möglicherweise Schmerzen verursachen, wird meist eine Behandlung des Wurzelkanalsystem erforderlich. Der irreversibel geschädigte Zahnnerv muss zur Beseitigung der Schmerzen entfernt und sämtliche Bakterien aus dem Wurzelkanalsystem beseitigt werden. Häufig sind die Zahnwurzeln gekrümmt oder weisen manchmal feine Nebenkanäle auf. Mit der sogenannten endometrischen Längenmessung (http://www.vdw-dental.com) , wird die Länge eines jeden Wurzelkanals über einen elektrischen Widerstand sehr genau und ohne Anwendung von Röntgenstrahlen vermessen. Anschließend wird jeder Wurzelkanal mit sehr feinen Spezialinstrumenten gesäubert (http://www.vdw-dental.com) und durch ein sorgfältiges Spülprotokoll desinfiziert, anschließend getrocknet und schließlich mit einem erwärmten, dichten Wurzelfüllmaterial dauerhaft verschlossen. Der Zahn erhält eine stabile Füllung, am besten aus Komposit und die Behandlung ist vorerst abgeschlossen. Da wurzelbehandelte Zähne nicht mehr durchblutet werden und mit der Zeit spröde und bruchanfällig werden, sollten sie nach einem Zeitraum von etwa einem halbem Jahr mit einer Zahnkrone geschützt werden.